ഡേവിഡ് ബേക്കർ
ഒരു അമേരിക്കൻ ബയോകെമിസ്റ്റും കമ്പ്യൂട്ടേഷണൽ ബയോളജിസ്റ്റുമാണ് ഡേവിഡ് ബേക്കർ (ജനനം: 1962 ഒക്ടോബർ 6, വാഷിംഗ്ടണിലെ സിയാറ്റിൽ).[3] പ്രോട്ടീനുകളുടെ ത്രിമാന ഘടന പ്രവചിക്കാനും രൂപകൽപ്പന ചെയ്യാനുമുള്ള മാർഗ്ഗങ്ങൾ അദ്ദേഹം മുന്നോട്ട് വച്ചിട്ടുണ്ട്. ഹെൻ‌റിയേറ്റ, ഓബ്രി ഡേവിസ് എൻ‌ഡോവ്ഡ് ബയോകെമിസ്ട്രി പ്രൊഫസറും വാഷിംഗ്ടൺ യൂണിവേഴ്സിറ്റിയിലെ ജീനോം സയൻസസ്, ബയോ എഞ്ചിനീയറിംഗ്, കെമിക്കൽ എഞ്ചിനീയറിംഗ്, കമ്പ്യൂട്ടർ സയൻസ്, ഫിസിക്സ് എന്നിവയുടെ അനുബന്ധ പ്രൊഫസറുമാണ്. ബയോമോളികുലർ സ്ട്രക്ചർ പ്രവചനവും ഡിസൈൻ സോഫ്റ്റ്വെയറും വികസിപ്പിക്കുന്ന ലാബുകളുടെയും ഗവേഷകരുടെയും കൺസോർഷ്യമായ റോസെറ്റ കോമൺസിന്റെ ഡയറക്ടറായി അദ്ദേഹം സേവനമനുഷ്ഠിക്കുന്നു. ഹോവാർഡ് ഹ്യൂസ് മെഡിക്കൽ ഇൻസ്റ്റിറ്റ്യൂട്ട് അന്വേഷകനും യുണൈറ്റഡ് സ്റ്റേറ്റ്സ് നാഷണൽ അക്കാദമി ഓഫ് സയൻസസിലെ അംഗവുമാണ്. വാഷിംഗ്ടൺ യൂണിവേഴ്സിറ്റി ഇൻസ്റ്റിറ്റ്യൂട്ട് ഫോർ പ്രോട്ടീൻ ഡിസൈനിന്റെ ഡയറക്ടർ കൂടിയാണ് അദ്ദേഹം. [4]
ഡേവിഡ് ബേക്കർ | |
|---|---|
 David Baker at the summit of Spark Plug Mountain, Washington, July 31, 2013 | |
| ജനനം | ഒക്ടോബർ 6, 1962 |
| കലാലയം | |
| അറിയപ്പെടുന്നത് | |
| ജീവിതപങ്കാളി(കൾ) | Hannele Ruohola-Baker |
| പുരസ്കാരങ്ങൾ | |
| ശാസ്ത്രീയ ജീവിതം | |
| പ്രവർത്തനതലം | computational biologist |
| സ്ഥാപനങ്ങൾ | |
| ഡോക്ടർ ബിരുദ ഉപദേശകൻ | Randy Schekman |
| മറ്റു അക്കാദമിക് ഉപദേശകർ | David Agard |
| ഡോക്ടറൽ വിദ്യാർത്ഥികൾ | Richard Bonneau |
| മറ്റു ശ്രദ്ധേയരായ വിദ്യാർത്ഥികൾ | Brian Kuhlman, Tanja Kortemme |
| വെബ്സൈറ്റ് | www |
ജീവിതം തിരുത്തുക
ബേക്കർ കാലിഫോർണിയ യൂണിവേഴ്സിറ്റി, ബെർക്ക്‌ലിയിലെ ബയോകെമിസ്ട്രിയിൽ റാണ്ടി സ്‌കെക്മാന്റെ ലബോറട്ടറിയിൽ ബിരുദം നേടി. അവിടെ പ്രോട്ടീൻ ഗതാഗതം, യീസ്റ്റിലെ ട്രാഫിക്കിങ്ങ് എന്നിവയിൽ പ്രധാനമായും പ്രവർത്തിച്ചു. സാൻ ഫ്രാൻസിസ്കോയിലെ കാലിഫോർണിയ സർവകലാശാലയിലെ ഡേവിഡ് അഗാർഡിനൊപ്പം അദ്ദേഹം പോസ്റ്റ്ഡോക്ടറൽ ജോലി ചെയ്തു.
പ്രോട്ടീൻ ഫോൾഡിങ്ങിനെക്കുറിച്ചുള്ള തന്റെ പ്രവർത്തനത്തിന് ബേക്കറിന് 2008 ലെ ബയോഫിസിക്സിലെ സാക്ലർ ഇന്റർനാഷണൽ പ്രൈസും [5] ലൈഫ് സയൻസസിലെ 2021 ബ്രേക്ക്‌ത്രൂ സമ്മാനവും ലഭിച്ചു . [6]
2009 ൽ അമേരിക്കൻ അക്കാദമി ഓഫ് ആർട്സ് ആൻഡ് സയൻസസിന്റെ ഫെലോ ആയി ബേക്കർ തിരഞ്ഞെടുക്കപ്പെട്ടു [7] യു‌ഡബ്ല്യുവിലെ മറ്റൊരു ബയോകെമിസ്റ്റായ ഹന്നെലെ റൂഹോള-ബേക്കറുമായി അദ്ദേഹം വിവാഹിതനായി. അവർക്ക് രണ്ടു കുട്ടികൾ ഉണ്ട്.
കരിയർ തിരുത്തുക
അബ് ഇനീഷ്യോ പ്രോട്ടീൻ ഘടന പ്രവചനത്തിനായി ബേക്കറിന്റെ ഗ്രൂപ്പ് റോസെറ്റ അൽഗോരിതം വികസിപ്പിച്ചെടുത്തു, ഇത് റോസെറ്റ @ ഹോം [8] [9], ഫോൾഡിറ്റ് എന്ന വിതരണ കമ്പ്യൂട്ടിംഗ് പ്രോജക്റ്റിലേക്ക് വ്യാപിപ്പിച്ചു. [10] [11] പ്രോട്ടീൻ കോംപ്ലക്സുകൾക്കും വ്യക്തിഗത പോളിപെപ്റ്റൈഡ് ശൃംഖലകൾക്കുമായി ഘടനാപരമായ മോഡലുകൾ നിർമ്മിക്കുകയാണ് പദ്ധതിയുടെ ലക്ഷ്യം. റോസെറ്റ പ്രോട്ടോക്കോളിന്റെ സ്വമേധയാ സഹായിക്കുന്നതും യാന്ത്രികവുമായ വകഭേദങ്ങൾ ഉൾപ്പെടെ, അബ് ഇനീഷ്യോ രീതികൾ ഉപയോഗിച്ച് സി‌എസ്‌പി ഘടന പ്രവചന പരീക്ഷണത്തിൽ ഗ്രൂപ്പ് പ്രത്യേകത പുലർത്തുന്നു. [12] [13]
അദ്ദേഹത്തിന്റെ ഗ്രൂപ്പിലെ അംഗങ്ങൾ പ്രോട്ടീൻ ഡിസൈൻ രംഗത്ത് സജീവമാണ്; ടോപ്പ് 7 എന്നറിയപ്പെടുന്ന ഒരു പ്രോട്ടീൻ രൂപകൽപ്പന ചെയ്യുന്നതിലൂടെ അവ ശ്രദ്ധേയമാണ്. [14]
പ്രോട്ടീൻ ഘടനയുടെയും പ്രവർത്തനത്തിന്റെയും കണക്കുകൂട്ടൽ പ്രവചനത്തിനുള്ള രീതികളുടെ വികാസത്തിന് പ്രാഥമികമായി അറിയാമെങ്കിലും, ബയോളജിയുടെ പരീക്ഷണാത്മക വിലയിരുത്തൽ നടത്തുന്നതിന് കമ്പ്യൂട്ടേഷണൽ രീതികൾ ഉപയോഗിക്കുന്നതിലും അദ്ദേഹത്തിന് താൽപ്പര്യമുണ്ട്; അദ്ദേഹത്തിന്റെ ലബോറട്ടറി ഒരു സജീവ പരീക്ഷണാത്മക ബയോകെമിസ്ട്രി ഗ്രൂപ്പ് പരിപാലിക്കുന്നു. 2016 ൽ ഇൻഫോസിസ് സമ്മാനത്തിനായി ലൈഫ് സയൻസസ് ജൂറിയിലും സേവനമനുഷ്ഠിച്ചു.
സ്റ്റേജുകളിൽ തിരുത്തുക
2018 ഡിസംബറിൽ കാലിഫോർണിയയിലെ സാൻ ഡീഗോയിൽ നടന്ന "ആന്റിബോഡി എഞ്ചിനീയറിംഗ്, ചികിത്സാ" സമ്മേളനത്തിൽ ബേക്കർ സംസാരിച്ചു. [15]
2019 ഏപ്രിലിൽ, കാനഡയിലെ വാൻ‌കൂവറിൽ TED2019 ൽ "പുതിയ പ്രോട്ടീനുകൾ രൂപകൽപ്പന ചെയ്യുന്നതിലൂടെ ഞങ്ങൾക്ക് പരിഹരിക്കാൻ കഴിയുന്ന 5 വെല്ലുവിളികൾ" എന്ന തലക്കെട്ടിൽ ഒരു ടെഡ് പ്രസംഗം ബേക്കർ നൽകി. [16]
അവലംബം തിരുത്തുക
- ↑ "David Baker". Arnold and Mabel Beckman Foundation. Archived from the original on 2 August 2018. Retrieved 1 August 2018.
- ↑ "Institute for Protein Design wins $45M in funding from TED's Audacious Project". 2019-04-17.
- ↑ Howes, Laura. "Protein wrangler, serial entrepreneur, and community builder". Chemistry and Engineering News. 97 (30).
- ↑ "UW to Establish Institute for Protein Design – Institute for Protein Design" (in അമേരിക്കൻ ഇംഗ്ലീഷ്). Retrieved 2019-01-14.
- ↑ Leila Gray (November 24, 2008). "University of Washington biochemist David Baker to receive 2008 Sackler International Prize in Biophysics for discoveries in protein folding". University of Washington. Retrieved April 29, 2013.
- ↑ Breakthrough Prize in Life Sciences 2021
- ↑ "Book of Members, 1780-2010: Chapter B" (PDF). American Academy of Arts and Sciences. Retrieved 5 May 2011.
- ↑ Castillo, Oscar; Melin, Patricia; Kacprzyk, Janusz, eds. (2018). Fuzzy Logic Augmentation of Neural and Optimization Algorithms: Theoretical Aspects and Real Applications. Springer. p. 455. ISBN 9783319710075. Retrieved 2 August 2018.
- ↑ Bonneau, Richard; Ruczinski, Ingo; Tsai, Jerry; Baker, David (August 2002). "Contact order and ab initio protein structure prediction". Protein Science. 11 (8): 1937–1944. doi:10.1110/ps.3790102. PMC 2373674. PMID 12142448.
- ↑ Hand, E. (2010). "Citizen science: People power". Nature. 466 (7307): 685–687. doi:10.1038/466685a. PMID 20686547.
- ↑ Cooper, S.; Khatib, F.; Treuille, A.; Barbero, J.; Lee, J.; Beenen, M.; Leaver-Fay, A.; Baker, D.; Popović, Z. (2010). "Predicting protein structures with a multiplayer online game". Nature. 466 (7307): 756–760. Bibcode:2010Natur.466..756C. doi:10.1038/nature09304. PMC 2956414. PMID 20686574.
- ↑ Dimaio, F.; Terwilliger, T. C.; Read, R. J.; Wlodawer, A.; Oberdorfer, G.; Wagner, U.; Valkov, E.; Alon, A.; Fass, D. (2011). "Improved molecular replacement by density- and energy-guided protein structure optimization". Nature. 473 (7348): 540–3. Bibcode:2011Natur.473..540D. doi:10.1038/nature09964. PMC 3365536. PMID 21532589.
- ↑ Qian, B.; Raman, S.; Das, R.; Bradley, P.; McCoy, A. J.; Read, R. J.; Baker, D. (2007). "High-resolution structure prediction and the crystallographic phase problem". Nature. 450 (7167): 259–64. Bibcode:2007Natur.450..259Q. doi:10.1038/nature06249. PMC 2504711. PMID 17934447.
- ↑ Kuhlman, Brian; Dantas, Gautam; Ireton, Gregory C.; Varani, Gabriele; Stoddard, Barry L.; Baker, David (21 November 2003). "Design of a Novel Globular Protein Fold with Atomic-Level Accuracy". Science. 302 (5649): 1364–1368. Bibcode:2003Sci...302.1364K. doi:10.1126/science.1089427. PMID 14631033.
- ↑ "Antibody Engineering and Therapeutics".
- ↑ "5 challenges we could solve by designing new proteins".
പുറത്തേക്കുള്ള കണ്ണികൾ തിരുത്തുക
- David Baker online talk: "Crowd Sourcing Protein Folding: Rosetta@Home and FoldIt" Archived 2017-07-02 at the Wayback Machine.
- David Baker online seminar: "Introduction to Protein Design" Archived 2016-04-01 at the Wayback Machine.
- David Baker online seminar: "Design of New Protein Functions" Archived 2016-04-01 at the Wayback Machine.