എൻസൈം കമ്മീഷൻ നമ്പർ
ഉൽപ്രേരകങ്ങളായി പ്രവർത്തിക്കുമ്പോഴുള്ള എൻസൈമുകളുടെ രാസപ്രവർത്തനത്തെ സൂചിപ്പിക്കാനുള്ള ഒരു സംഖ്യാരീതിയാണ് എൻസൈം കമ്മീഷൻ നമ്പർ അഥവാ ഇസി നമ്പർ (The Enzyme Commission number (EC number)).[1] എൻസൈം നാമകരണപദ്ധതിയുടെ ഭാഗമായതിനാൽ ഓരോ ഇ സി നമ്പറിനും ആ എൻസൈമുമായി ബന്ധമുള്ള ശുപാർശചെയ്യപ്പെട്ട ഒരു പേരുണ്ടാവും.
കൃത്യമായിപ്പറഞ്ഞാൽ ഇ സി നമ്പർ ഓരോ എൻസൈമുകൾ ഏതാണെന്നു മനസ്സിലാക്കാനുള്ളതല്ല, മറിച്ച് എൻസൈം മൂലമുള്ള ഉൽപ്രേരകപ്രവർത്തനങ്ങളെപ്പറ്റി പറയാനാണ്. ഉദാഹരണത്തിന് വെവ്വേറെ എൻസൈമുകൾ ഒരേതരത്തിൽ ഉല്പ്രേരകങ്ങളായി പ്രവർത്തിക്കുന്നുണ്ടെങ്കിൽ അവയ്ക്ക് ഒരേ ഇ സി നമ്പറായിരിക്കും ഉണ്ടാവുക.[2] കൂടാതെ ഒരുമിച്ചുള്ള പരിണാമങ്ങളിൽക്കൂടി വ്യത്യസ്തമായ മാംസ്യ ഫോൾഡുകൾ ഒരേപോലെയുള്ള പ്രതിപ്രവർത്തനങ്ങളിൽ ഒരേപോലെയുള്ള ഉൽപ്രേരകങ്ങളായി പ്രവർത്തിക്കുന്നവയ്ക്ക് ഒരേതരത്തിലുള്ള ഇ സി നമ്പർ ആവാം ഉണ്ടാകുന്നത്.[3].[4]
നമ്പറിന്റെ ഫോർമാറ്റ്
തിരുത്തുകEvery enzyme code consists of the letters "EC" followed by four numbers separated by periods. Those numbers represent a progressively finer classification of the enzyme. Preliminary EC numbers exist and have an 'n' as part of the fourth (serial) digit (e.g. EC 3.5.1.n3).
For example, the tripeptide aminopeptidases have the code "EC 3.4.11.4", whose components indicate the following groups of enzymes:
- EC 3 enzymes are hydrolases (enzymes that use water to break up some other molecule)
- EC 3.4 are hydrolases that act on peptide bonds
- EC 3.4.11 are those hydrolases that cleave off the amino-terminal amino acid from a polypeptide
- EC 3.4.11.4 are those that cleave off the amino-terminal end from a tripeptide
ഉയർന്ന ശ്രേണിയിലുള്ള കോഡുകൾ
തിരുത്തുകClass | Reaction catalyzed | Typical reaction | Enzyme example(s) with trivial name |
---|---|---|---|
EC 1 Oxidoreductases |
To catalyze oxidation/reduction reactions; transfer of H and O atoms or electrons from one substance to another | AH + B → A + BH (reduced) A + O → AO (oxidized) |
Dehydrogenase, oxidase |
EC 2 Transferases |
Transfer of a functional group from one substance to another. The group may be methyl-, acyl-, amino- or phosphate group | AB + C → A + BC | Transaminase, kinase |
EC 3 Hydrolases |
Formation of two products from a substrate by hydrolysis | AB + H2O → AOH + BH | Lipase, amylase, peptidase, phosphatase |
EC 4 Lyases |
Non-hydrolytic addition or removal of groups from substrates. C-C, C-N, C-O or C-S bonds may be cleaved | RCOCOOH → RCOH + CO2 or [X-A+B-Y] → [A=B + X-Y] | Decarboxylase |
EC 5 Isomerases |
Intramolecule rearrangement, i.e. isomerization changes within a single molecule | ABC → BCA | Isomerase, mutase |
EC 6 Ligases |
Join together two molecules by synthesis of new C-O, C-S, C-N or C-C bonds with simultaneous breakdown of ATP | X + Y + ATP → XY + ADP + Pi | Synthetase |
സമാനമായ പ്രതിപ്രവർത്തനം
തിരുത്തുകSimilarity between enzymatic reactions (EC) can be calculated by using bond changes, reaction centres or substructure metrics (EC-BLAST Archived 2019-05-30 at the Wayback Machine.).[6]
ചരിത്രം
തിരുത്തുകഇവയും കാണുക
തിരുത്തുക- List of EC numbers
- List of enzymes
- TC number (classification of membrane transport proteins)
അവലംബം
തിരുത്തുക- ↑ Webb EC (1992). Enzyme nomenclature 1992: recommendations of the Nomenclature Committee of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology on the nomenclature and classification of enzymes. San Diego: Published for the International Union of Biochemistry and Molecular Biology by Academic Press. ISBN 0-12-227164-5.
- ↑ "ENZYME (Enzyme nomenclature database)". ExPASy. Archived from the original on 2006-02-18. Retrieved 2006-03-14.
- ↑ "Non-homologous isofunctional enzymes: a systematic analysis of alternative solutions in enzyme evolution". Biology Direct. 5: 31. 2010. doi:10.1186/1745-6150-5-31. PMC 2876114. PMID 20433725.
{{cite journal}}
: CS1 maint: unflagged free DOI (link) - ↑ "UniProt: the Universal Protein knowledgebase". Nucleic Acids Research. 32 (Database issue): D115–9. Jan 2004. doi:10.1093/nar/gkh131. PMC 308865. PMID 14681372.
- ↑ Moss GP. "Recommendations of the Nomenclature Committee". International Union of Biochemistry and Molecular Biology on the Nomenclature and Classification of Enzymes by the Reactions they Catalyse. Retrieved 2006-03-14.
- ↑ "EC-BLAST: a tool to automatically search and compare enzyme reactions". Nature Methods. 11 (2): 171–4. Feb 2014. doi:10.1038/nmeth.2803. PMC 4122987. PMID 24412978.
പുറത്തേക്കുള്ള കണ്ണികൾ
തിരുത്തുക- Enzyme Nomenclature, authoritative website by the Nomenclature Committee of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology, maintained by G.P. Moss
- Enzyme nomenclature database — by ExPASy
- List of all EC numbers — by BRENDA
- Browse PDB structures by EC number
- Browse SCOP domains by EC number Archived 2023-02-21 at the Wayback Machine. — by dcGO
- Compare EC numbers using EC-Blast Archived 2019-05-30 at the Wayback Machine.